Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sar1bQ9CQC9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sar1bQ9CQC9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sar1bQ9CQC9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Sar1bQ9CQC9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sar1bQ9CQC9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sar1bQ9CQC9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms