Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufa3Q9CQ91 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ndufa3Q9CQ91 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ndufa3Q9CQ91 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa3Q9CQ91 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa3Q9CQ91 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa3Q9CQ91 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa3Q9CQ91 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa3Q9CQ91 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa3Q9CQ91 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa3Q9CQ91 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ndufa3Q9CQ91 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ndufa3Q9CQ91 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms