Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
1700129C05RikQ9CQ77 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
1700129C05RikQ9CQ77 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
1700129C05RikQ9CQ77 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
1700129C05RikQ9CQ77 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms