Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmc1Q9CPZ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmc1Q9CPZ8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmc1Q9CPZ8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cmc1Q9CPZ8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmc1Q9CPZ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmc1Q9CPZ8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmc1Q9CPZ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmc1Q9CPZ8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmc1Q9CPZ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms