Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nsmce3Q9CPR8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nsmce3Q9CPR8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nsmce3Q9CPR8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nsmce3Q9CPR8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nsmce3Q9CPR8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms