Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krt88Q9CPR6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt88Q9CPR6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt88Q9CPR6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Krt88Q9CPR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms