Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Bap1Q99PU7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Bap1Q99PU7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bap1Q99PU7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bap1Q99PU7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bap1Q99PU7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bap1Q99PU7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bap1Q99PU7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bap1Q99PU7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bap1Q99PU7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Bap1Q99PU7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Bap1Q99PU7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Bap1Q99PU7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Bap1Q99PU7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Bap1Q99PU7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms