Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Trim26Q99PN3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Trim26Q99PN3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trim26Q99PN3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Trim26Q99PN3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trim26Q99PN3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms