Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930550L24RikQ99PA7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930550L24RikQ99PA7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
4930550L24RikQ99PA7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930550L24RikQ99PA7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms