Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc26a5Q99NH7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc26a5Q99NH7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc26a5Q99NH7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc26a5Q99NH7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc26a5Q99NH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc26a5Q99NH7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc26a5Q99NH7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc26a5Q99NH7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc26a5Q99NH7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms