Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pcgf6Q99NA9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pcgf6Q99NA9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pcgf6Q99NA9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pcgf6Q99NA9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Pcgf6Q99NA9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Pcgf6Q99NA9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pcgf6Q99NA9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms