Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tpgs1Q99MS8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tpgs1Q99MS8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tpgs1Q99MS8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tpgs1Q99MS8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpgs1Q99MS8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpgs1Q99MS8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpgs1Q99MS8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpgs1Q99MS8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpgs1Q99MS8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpgs1Q99MS8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tpgs1Q99MS8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.5 ms