Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BrapQ99MP8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BrapQ99MP8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BrapQ99MP8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BrapQ99MP8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BrapQ99MP8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BrapQ99MP8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BrapQ99MP8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BrapQ99MP8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BrapQ99MP8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BrapQ99MP8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BrapQ99MP8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BrapQ99MP8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 944.9 ms