Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr3Q99MB1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr3Q99MB1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tlr3Q99MB1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tlr3Q99MB1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tlr3Q99MB1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms