Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcbtb2Q99LJ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcbtb2Q99LJ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcbtb2Q99LJ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rcbtb2Q99LJ7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rcbtb2Q99LJ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rcbtb2Q99LJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms