Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cttnbp2nlQ99LJ0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cttnbp2nlQ99LJ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2nlQ99LJ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2nlQ99LJ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms