Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cstf3Q99LI7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cstf3Q99LI7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cstf3Q99LI7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cstf3Q99LI7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms