Protein–RNA interactions for Protein: Q99KS2

Ngrn, Neugrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgrnQ99KS2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NgrnQ99KS2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NgrnQ99KS2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NgrnQ99KS2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NgrnQ99KS2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms