Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Pls3Q99K51 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pls3Q99K51 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pls3Q99K51 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pls3Q99K51 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pls3Q99K51 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms