Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lims1Q99JW4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lims1Q99JW4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Lims1Q99JW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Lims1Q99JW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms