Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdelr1Q99JH8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kdelr1Q99JH8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kdelr1Q99JH8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kdelr1Q99JH8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Kdelr1Q99JH8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kdelr1Q99JH8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms