Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB6

Foxp3, Forkhead box protein P3, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp3Q99JB6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxp3Q99JB6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxp3Q99JB6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxp3Q99JB6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Foxp3Q99JB6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Foxp3Q99JB6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms