Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Ddb2Q99J79 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ddb2Q99J79 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Ddb2Q99J79 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ddb2Q99J79 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Ddb2Q99J79 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ddb2Q99J79 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Ddb2Q99J79 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ddb2Q99J79 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Ddb2Q99J79 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Ddb2Q99J79 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Ddb2Q99J79 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Ddb2Q99J79 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ddb2Q99J79 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Ddb2Q99J79 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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