Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Apobec3Q99J72 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Apobec3Q99J72 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Apobec3Q99J72 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apobec3Q99J72 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms