Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trps1Q925H1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trps1Q925H1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trps1Q925H1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trps1Q925H1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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