Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Riok1Q922Q2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Riok1Q922Q2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Riok1Q922Q2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Riok1Q922Q2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Riok1Q922Q2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Riok1Q922Q2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms