Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msi2Q920Q6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Msi2Q920Q6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Msi2Q920Q6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Msi2Q920Q6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Msi2Q920Q6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms