Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FdpsQ920E5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FdpsQ920E5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FdpsQ920E5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FdpsQ920E5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms