Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Synpo2Q91YE8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Synpo2Q91YE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Synpo2Q91YE8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Synpo2Q91YE8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms