Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdha5Q91Y15 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha5Q91Y15 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha5Q91Y15 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pcdha5Q91Y15 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha5Q91Y15 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms