Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pcdhb12Q91Y07 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcdhb12Q91Y07 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcdhb12Q91Y07 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcdhb12Q91Y07 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcdhb12Q91Y07 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pcdhb12Q91Y07 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms