Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY7

Pcdhga12, Protocadherin gamma A12, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga12Q91XY7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdhga12Q91XY7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdhga12Q91XY7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcdhga12Q91XY7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcdhga12Q91XY7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.1 ms