Protein–RNA interactions for Protein: Q91V98

Cd248, Endosialin, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd248Q91V98 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd248Q91V98 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd248Q91V98 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd248Q91V98 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd248Q91V98 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd248Q91V98 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cd248Q91V98 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd248Q91V98 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd248Q91V98 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cd248Q91V98 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cd248Q91V98 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd248Q91V98 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cd248Q91V98 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cd248Q91V98 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd248Q91V98 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cd248Q91V98 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Cd248Q91V98 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd248Q91V98 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms