Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp25Q8VIK1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snrnp25Q8VIK1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrnp25Q8VIK1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrnp25Q8VIK1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snrnp25Q8VIK1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Snrnp25Q8VIK1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Snrnp25Q8VIK1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snrnp25Q8VIK1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrnp25Q8VIK1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrnp25Q8VIK1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snrnp25Q8VIK1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrnp25Q8VIK1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrnp25Q8VIK1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snrnp25Q8VIK1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms