Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Ppargc1bQ8VHJ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Ppargc1bQ8VHJ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms