Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDV0

Itgbl1, Integrin beta-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgbl1Q8VDV0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Itgbl1Q8VDV0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Itgbl1Q8VDV0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Itgbl1Q8VDV0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Itgbl1Q8VDV0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Itgbl1Q8VDV0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Itgbl1Q8VDV0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Itgbl1Q8VDV0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Itgbl1Q8VDV0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Itgbl1Q8VDV0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Itgbl1Q8VDV0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25,37■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Itgbl1Q8VDV0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Itgbl1Q8VDV0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,5 ms