Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDJ3

Hdlbp, Vigilin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdlbpQ8VDJ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HdlbpQ8VDJ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HdlbpQ8VDJ3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HdlbpQ8VDJ3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HdlbpQ8VDJ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HdlbpQ8VDJ3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms