Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sgip1Q8VD37 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sgip1Q8VD37 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sgip1Q8VD37 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Sgip1Q8VD37 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sgip1Q8VD37 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sgip1Q8VD37 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sgip1Q8VD37 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms