Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCX6

Kptn, KICSTOR complex protein kaptin, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KptnQ8VCX6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KptnQ8VCX6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KptnQ8VCX6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KptnQ8VCX6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KptnQ8VCX6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms