Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt25Q8VCW2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt25Q8VCW2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt25Q8VCW2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt25Q8VCW2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms