Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Kdm4cQ8VCD7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm4cQ8VCD7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kdm4cQ8VCD7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm4cQ8VCD7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm4cQ8VCD7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms