Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab11fip5Q8R361 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab11fip5Q8R361 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab11fip5Q8R361 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms