Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Impg1Q8R1W8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Impg1Q8R1W8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Impg1Q8R1W8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Impg1Q8R1W8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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