Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxc12Q8K5B8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc12Q8K5B8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxc12Q8K5B8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc12Q8K5B8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc12Q8K5B8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms