Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Treml1Q8K558 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Treml1Q8K558 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Treml1Q8K558 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Treml1Q8K558 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Treml1Q8K558 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Treml1Q8K558 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Treml1Q8K558 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Treml1Q8K558 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Treml1Q8K558 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Treml1Q8K558 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Treml1Q8K558 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms