Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E0

Stx5, Syntaxin-5, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx5Q8K1E0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx5Q8K1E0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx5Q8K1E0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Stx5Q8K1E0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms