Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lmbrd1Q8K0B2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lmbrd1Q8K0B2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms