Protein–RNA interactions for Protein: Q8K039

Uncharacterized protein KIAA1143 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8K039 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8K039 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8K039 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8K039 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8K039 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8K039 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q8K039 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8K039 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8K039 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8K039 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8K039 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8K039 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q8K039 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8K039 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8K039 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8K039 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q8K039 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8K039 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8K039 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8K039 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8K039 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8K039 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8K039 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q8K039 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q8K039 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8K039 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8K039 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8K039 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8K039 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q8K039 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8K039 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8K039 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8K039 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8K039 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q8K039 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8K039 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8K039 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8K039 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8K039 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8K039 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8K039 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q8K039 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8K039 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8K039 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8K039 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8K039 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8K039 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q8K039 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8K039 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8K039 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q8K039 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8K039 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8K039 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8K039 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8K039 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q8K039 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q8K039 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8K039 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8K039 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q8K039 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8K039 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8K039 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8K039 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8K039 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8K039 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8K039 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8K039 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8K039 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q8K039 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q8K039 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q8K039 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q8K039 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q8K039 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q8K039 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q8K039 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q8K039 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q8K039 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q8K039 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q8K039 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q8K039 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q8K039 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q8K039 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q8K039 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q8K039 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q8K039 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q8K039 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q8K039 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q8K039 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q8K039 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q8K039 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q8K039 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms