Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rasgef1bQ8JZL7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rasgef1bQ8JZL7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms