Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJF9

Ago3, Protein argonaute-3, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ago3Q8CJF9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ago3Q8CJF9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ago3Q8CJF9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ago3Q8CJF9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ago3Q8CJF9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ago3Q8CJF9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.3 ms